
浅析DNA简化基因组甲基化问题
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- 来源:
- 发布时间:2021-10-27 11:55
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【概要描述】问:什么是表观遗传转化? A:基因组表观转基因主要包括DNA简化基因组甲基化修饰和核小体中粗蛋白质的修饰等,改变DNA的空间结构或染色体结构
浅析DNA简化基因组甲基化问题
【概要描述】问:什么是表观遗传转化?
A:基因组表观转基因主要包括DNA简化基因组甲基化修饰和核小体中粗蛋白质的修饰等,改变DNA的空间结构或染色体结构
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问:什么是表观遗传转化?
A:基因组表观转基因主要包括DNA简化基因组甲基化修饰和核小体中粗蛋白质的修饰等,改变DNA的空间结构或染色体结构,导致基因沉默或过度表达。这两个公式都是在不改变DNA碱基的种类和数量的情况下,使生物体的表型多样化。
问:DNA简化基因组甲基化是什么?
A: DNA简化基因组甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,将甲基选择性地添加到细胞阵中,形成5’-甲胺的过程。
问:DNA简化基因组甲基化修饰的作用是什么?
A: DNA甲基化是所有高等生物中最先发现的表观修饰,通过改变基因的碱基序列而不改变基因的表达来影响细胞的功能。与基因沉默、X染色体停用、基因组印迹、RNA I、肿瘤等生物事件密切相关,它们的共同作用机制是调节基因的表达。
问:DNA简化基因组甲基化类型在其他生物中是否相同?
甲:当然不一样。原核生物的甲基化多发生在CCA/TGG和GATC序列中,真核生物的DNA甲基化一般只发生在CpG部位,哺乳动物DNA甲基化是CpG岛的胞嘧啶,植物甲基化只发生在CpG和CpNpG。
问:CpG岛是什么?
答:CpG双核苷酸在人类基因组中分布不均匀,基因组部分段CpG序列密度高,平均可达5倍以上,即所谓的CpG岛。CpG岛主要位于基因的启动子(promotor)和第一Exon地区,约60%的基因包含CpG岛。CpG岛的GC含量在50%以上,经常出现在真核生物的编码基因调节区。
问:CpG岛为什么要有“P”,而不是CG岛?P的特殊意义是什么?
答:CpG是胞嘧啶-磷酸-鸟氨酸的缩写,P代表磷酸。
问:如何预测CpG岛?
答:CpG岛地区小,研究更方便,因此很多研究热点集中在CpG岛甲基化状态研究上。研究CpG岛甲基化的前提是确认最合适的CpG岛地区。
问:如何验证特定甲基化部位并分析甲基化程度?
答:利用对照组和实验组样本进行甲基化验证。
(1) MSP方法:可以对特定部位进行甲基化验证,适用于甲基化芯片结果,不能进行甲基化程度分析。
(2) BSP复制测序方法:确认特定相关基因的甲基化部位,准确计算甲基化程度。(3) HRM方法:适用于大量样品甲基化验证,可计算甲基化程度。
(4)焦炭磷酸测序:测序的有效长度不超过60bp,准确定量各CpG部位。
(5)MASARRAY平台:对单个基因子区域的甲基化检测每种反应最多涵盖500 BP的多个CpG位。准确定量各CpG部位。
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