这是描述信息
资讯分类

WGBS高通量DNA甲基化测序技术

  • 分类:新闻中心
  • 作者:
  • 来源:
  • 发布时间:2022-04-26 09:37
  • 访问量:

【概要描述】DNA甲基化是在不改变碱基序列的情况下参与调节蛋白质合成的表观调节修饰。对人类来说,DNA甲基化是一种非常奇妙的化学修饰。亲人的关怀、机体的老化、吸烟、酒精中毒,甚至肥胖都被甲基化,真实地记录在基因组中。基因组就像日记本一样,甲基化用文字记录人体的经验。事实上,WGBS(痛苦测量顺序技术)可以满足以下要求。

WGBS高通量DNA甲基化测序技术

【概要描述】DNA甲基化是在不改变碱基序列的情况下参与调节蛋白质合成的表观调节修饰。对人类来说,DNA甲基化是一种非常奇妙的化学修饰。亲人的关怀、机体的老化、吸烟、酒精中毒,甚至肥胖都被甲基化,真实地记录在基因组中。基因组就像日记本一样,甲基化用文字记录人体的经验。事实上,WGBS(痛苦测量顺序技术)可以满足以下要求。

  • 分类:新闻中心
  • 作者:
  • 来源:
  • 发布时间:2022-04-26 09:37
  • 访问量:
详情

  DNA甲基化是在不改变碱基序列的情况下参与调节蛋白质合成的表观调节修饰。对人类来说,DNA甲基化是一种非常奇妙的化学修饰。亲人的关怀、机体的老化、吸烟、酒精中毒,甚至肥胖都被甲基化,真实地记录在基因组中。基因组就像日记本一样,甲基化用文字记录人体的经验。事实上,WGBS(痛苦测量顺序技术)可以满足以下要求。

  与众不同的癌细胞也有一系列特殊的甲基化标记,形成癌细胞独有的甲基化ID。在CfDNA中搜索这个ID,可以检测癌 症的存在,甚至可以提前发现癌 症,这就是利用ctDNA甲基化进行癌 症早诊体质的原理。

  与点突变信号相比,CtDNA甲基化标志物具有信号特异性、定位肿瘤等优点。近年来,ctDNA甲基化在癌 症诊断、预后评估等研究方面取得了很大进展。

  但是我们似乎忽略了目前研究手段的局限性。首先,我们没有强大的肿瘤甲基化标志物筛选方法。常用的甲基化芯片只覆盖人类~3%的甲基化部位,仅限于相对甲基化水平。二,像检测ctDNA点突变一样,还没有高灵敏度的ctDNA甲基化检测技术。

  全球转基因生物序列(WGBS)是全基因组亚硫酸氢测序,它可以覆盖所有甲基化部位,并配合靶向技术检测低频甲基化信号,但现有WGBS数据存在严重问题。一旦特定地区CpG位数增加,一方面银行至少需要g级DNA,再加上偏爱高甲基化DNA 片段的现象,测序成本昂贵,基本属于NGS的奢侈品。

  令人高兴的是,“花瓶”技术WGBS在多年的积累后再次复苏。WGBS是高通量单分子甲基化研究的基础,它的突破翻开了甲基化研究的新篇章。接下来,我将简要介绍WGBS技术发展的心情。

  有趣的是,进化人类学研究给WGBS技术创新带来了新的启示。每天,古代人类的牙齿、头骨和同伙勇士也经历了类似的困难。他们的研究需要对旧DNA进行测序,这些旧DNA被BS处理的状态一样严重分解,大多数以单链形式存在,重点包含U碱基(图4左)。当时没有能够处理这种状态DNA的数据库构建技术,所以他们自己开发了一种新的单链数据库构建方法,虽然效率不是特别高,但已经可以满足分析需求了。


关键词:

扫二维码用手机看

这是描述信息

邮箱:marketing@sz-acegen.com

官网:http://www.sz-acegen.com

地址:深圳市龙岗区立信路43号永昌大厦407-408室

龚老师企业微信

龚老师企业微信

张老师企业微信

张老师企业微信

微信公众号

微信公众号

Copyright © 2021  |  深圳市艾斯基因科技有限公司 All Rights Reserved.  |   粤ICP备16072881号  |  网站建设:中企动力 龙岗