
微量细胞WGBS技术揭示克隆胚胎异常
- 分类:新闻中心
- 作者:
- 来源:
- 发布时间:2022-05-26 11:38
- 访问量:
【概要描述】 单细胞及微量样品的DNA甲基化组织学研究在很大程度上受到建仓测序技术的制约。传统的文库构建方法或与基因组DNA相似的单细胞扩增技术很难应用于甲基化实验过程。异性基因可以建立基于线性扩增和单一官仓的技术,从而充分降低文库偏好,正确完成珍贵样品的全基因组甲基化研究。下面WGBS厂家详细为大家介绍。
微量细胞WGBS技术揭示克隆胚胎异常
【概要描述】 单细胞及微量样品的DNA甲基化组织学研究在很大程度上受到建仓测序技术的制约。传统的文库构建方法或与基因组DNA相似的单细胞扩增技术很难应用于甲基化实验过程。异性基因可以建立基于线性扩增和单一官仓的技术,从而充分降低文库偏好,正确完成珍贵样品的全基因组甲基化研究。下面WGBS厂家详细为大家介绍。
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单细胞及微量样品的DNA甲基化组织学研究在很大程度上受到建仓测序技术的制约。传统的文库构建方法或与基因组DNA相似的单细胞扩增技术很难应用于甲基化实验过程。异性基因可以建立基于线性扩增和单一官仓的技术,从而充分降低文库偏好,正确完成珍贵样品的全基因组甲基化研究。下面WGBS厂家详细为大家介绍。
实验结果:
1.不同发展潜力的SCNT胚胎间DNA甲基化
研究人员利用微量细胞全基因组中亚硫酸盐测序(scWGBS)技术,在移植具有不同细胞发育命运的克隆胚胎之前的发育过程中绘制了全基因组、单碱基分辨率DNA甲基化图。获得了从供体卵细胞到囊胞的SCNT胚胎的WGBS数据,并与先前研究中修改后的胚胎的WGBS数据进行了比较,结果表明,SCNT胚胎组中全基因组超DNA甲基化模式存在,不完全DNA去甲基化可能与SCNT胚胎的发育阻断有密切关系。此外,研究人员在胚胎期内部细胞团(ICM)和滋养外胚胎层(TE)样本中识别了数千个区域的异常变化,这可能是降低SCNT移植成功率的重要原因。资料显示,DNA甲基化损伤可能是移植前SCNT胚胎不可避免的障碍。
2.WGBS胚胎中异常DNA再甲基化
与正常受精胚胎组发育过程不同,SCNT胚胎组出现异常甲基化水平上升现象。为了探索SCNT胚胎的潜在分子机制,研究人员比较了SCNT胚胎组和受精胚胎组之间的差异甲基化区域(DMR),确定了广泛的再甲基化区域(rDMR),这种反复甲基化现象在发育受阻的克隆胚胎中更为明显。总的来说,上述结果提高了SCNT胚胎基因组中rDMR发挥明显障碍作用的可能性,适当去除rDMR可以挽救卵 裂阶段的发育阻断,促进胚胎发育。
3.Scnt胚胎的超甲基化导致转录组障碍。
WGBS厂家表示通过对SCNT胚胎的转录组和DNA甲基化组数据,在WGCNA(加权基因联合表达网络分析)的基础上,与SCNT胚胎组相比,异常DNA超甲基化,特别是甲基化可以调节核心发育基因,从而促进SCNT胚胎的发育能力,部分逆转录转座子更有可能抵抗去甲基化。
4.抑制DNA再甲基化可以促进SCNT胚胎的发育。
在不完全再甲基化与SCNT胚胎发育失败之间产生相关性后,研究人员分析了抑制再甲基化是否能改善克隆动物的不良发育,探讨了DNA甲基转移酶(Dnmts)在早期克隆过程中对全基因组再甲基化模式的影响。结果表明,干扰Dnmts的表达可以有效降低克隆胚胎中异常DNA甲基化水平,激活克隆胚胎的特定译本,提高克隆胚胎体内发育效率。
5.DNA修饰和组蛋白修饰剂的组合处理可以提高复制效率。
WGBS厂家表示研究人员探讨了DNA修饰和组蛋白修饰的组合处理对异常DNA甲基化标记丢失后的影响,发现克隆胚胎异常DNA再甲基化和组蛋白再编程缺陷是相对独立的两个障碍。表明,多种表观遗传调节剂的组合处理可能是实现更高复制效率的较有希望的方法之一。
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