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DNA甲基化芯片的应用

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  • 发布时间:2022-08-09 09:43
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【概要描述】  DNA甲基化芯片是表观遗传学的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育和人类细胞瘤发生等方面发挥着重要作用,是近年来新的研究热点之一。随着甲基化进行研究的深入,各种甲基化检测技术方法发展应运而生。

DNA甲基化芯片的应用

【概要描述】  DNA甲基化芯片是表观遗传学的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育和人类细胞瘤发生等方面发挥着重要作用,是近年来新的研究热点之一。随着甲基化进行研究的深入,各种甲基化检测技术方法发展应运而生。

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  DNA甲基化芯片是表观遗传学的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育和人类细胞瘤发生等方面发挥着重要作用,是近年来新的研究热点之一。随着甲基化进行研究的深入,各种甲基化检测技术方法发展应运而生。

  DNA甲基化检测方法包括甲基化特异性PCR(MS-PCR)、亚硫酸氢盐处理+测序、亚硫酸氢钠限制性核酸内切酶分析(COBRA)、荧光定量、微阵列技术和高通量测序。

  基于芯片的甲基化图谱分析,很多芯片公司都提供对应DNA甲基化的产品。

  1.Illumina 450K DNA甲基化基因芯片

  Illumina Human Methylation 450K BeadChip 可检测以及整个社会人类进行基因组中的 450.000 个甲基化位点,覆盖 96% 的 CpG 岛,并根据需要在人体干细胞中添加 CpG 岛以外的 CpG 位点和非 CpG 甲基化位点 斑点,正常情况下的差异甲基化位点组织和细胞瘤组织、编码区外的 CpG 岛、miRNA 启动子区域以及疾病相关区域中通过 GWAS 的位点,覆盖了人类甲基化 27 BeadChip 的 90% 位点。每个芯片可以并行检测 12 个样本。结合学生全面、样品通量高、价格实惠等优势,广泛可以应用于干细胞进行研究、细胞瘤等疾病相关研究。是一种适用于表观基因组关联分析的全基因组DNA甲基化芯片。

  2.Infinium methylationepic beadchip (850k chip for short)

  在原450k 芯片成功的基础上,介绍了新一代 DNA 甲基化芯片。数据中纳入了原450K芯片91%的位点,充分利用了原450K珍贵历史数据,新增位点413745个(共853307个CpG位点)。 850K芯片全面覆盖了ENCODE和FANTOM5项目中发现的基因启动子区、基因编码区、CpG岛和增强子区。850K甲基化芯片不仅是研究细胞瘤等复杂疾病的有力工具,而且是研究表观基因组关联分析的合适的DNA甲基化技术。

  3.Roche-NimbleGen 全基因组进行拼接技术芯片

  每组芯片覆盖全基因组,平均间距在100bp以内,可以研究DNA甲基化对基因间和基因转录本内基因的影响。除了常规的人类、大鼠和小鼠,芯片还包括重要的模式生物,如果蝇、线虫、酵母和大肠杆菌。

  4.microRNA DNA甲基化芯片

  2008年,生物学家开始关注microRNA自身的调控机制。研究可以发现,细胞瘤细胞组织中一些问题具有抑癌功能的微小RNA发生DNA甲基化,其转录受到一定抑制,从而影响导致中国恶性病变发生和细胞瘤转移。目前,microRNA对DNA甲基化的调控已成为生物学研究的新热点。 Roche-NimbleGen推出的三款甲基化基因芯片和我们康成生物技术公司进行设计的一款具有甲基化控制芯片(芯片企业生产工作仍由NimbleGen完成)可用于中国人和提高小鼠microRNA的DNA甲基化的高通量分析研究。地下室监管。

  5.DNA甲基化芯片技术及临床应用

  有多种方法可以研究 DNA 甲基化。高通量芯片技术的应用大大加快了 DNA 甲基化与恶性病变、心血管疾病、糖尿病等疾病关系的研究进程。提高教学研究工作效率很可能发展已经成为我们人类疾病诊断、预防和治疗的有效工具。


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