
简化基因组甲基化测序 (RRBS)
RRBS最高性价比甲基化检测方案
简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),
通过酶切富集启动子及CpG 岛区域,并进行Bisulfite 测序;
作为最高性价比的甲基化研究方法,RRBS在大规模临床样本的研究中具有广泛的应用;
在经典RRBS基础上,艾斯基因在国内首家推出强化版 RRBS,助力全基因组甲基化测序,
可覆盖全基因组范围内超过6-9M个CpG 位点,>90%数量的CpG岛及>85%数量的基因启动子。
核心技术质控,用心服务每一个项目
艾斯团队专注表观组学10年,提供专业有价值的DNA甲基化完整解决方案;
最早开发RRBS技术团队之一, 国内首家推出强化版RRBS服务;
已经完成人、哺乳动物及鱼类等多个物种, 10000+例样本项目经验;
严格的RRBS技术质控,MSPI酶切率>95%, Bisulfite转化率>99%;
自动化样本处理、建库及分析流程,保障高效周期,40天极速交付;
低至10ng建库,满足穿刺、流式分选、微切等微量珍贵样本的研究;
核心团队在Nature、Epigenetics、DNA Res等杂志发表多篇SCI论文;
专业的生物信息分析团队, 提供更多个性化分析思路和方案。
科学方案设计
从项目方案、样本处理、建库测序,到数据分析;
每个项目需要专业、有价值的建议;及时高效的沟通,以保障高质量研究成果。
样本类型和要求
样本类型 |
样本要求 |
基因组DNA |
总量≥ 1ug; 浓度≥ 30ng/ul; 完整性好; 基于Qubit定量 |
细胞、全血、动物新鲜冷冻组织 |
按照送样要求准备 |
备注1:不推荐FFPE、cfDNA等片段化样本类型; 备注2:不适合植物物种; |
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备注2:用封口膜密封样品; 干冰运输 |
数据分析
RRBS |
分析内容 |
备注 |
标准分析 |
1、测序数据质量评估 |
过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
2、与参考基因组比对 |
比对率和覆盖度分析 |
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3、MSPI酶切及Bisulfite转化率质控 |
MSPI酶切效率>95%; Bisulfite转化率>99% |
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4、甲基化位点Calling |
评估胞嘧啶甲基化状态 |
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5、甲基化分布图谱分析 |
甲基化在基因组、功能元件上的分布 |
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6、组间差异甲基化DMR分析 |
寻找DMR及注释 |
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7、差异甲基化基因DMG分析 |
DMG富集分析GO,KEGG |
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8、多样本聚类分析 |
PCA分析多样本甲基化变化规律 |
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高级分析 |
9、多组学整合关联分析 |
例如与转录组关联分析 |
10、其它定制化分析 |
结合课题背景亮点挖掘 |