
甲基化DNA免疫沉淀测序 (MeDIP-seq)
甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-seq)
甲基化DNA免疫沉淀测序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq),
采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段测序,
可以在全基因组水平上进行高精度的CpG密集的高甲基化区域研究,
是分析基因组DNA甲基化变化的一种准确可靠的技术。
用心服务每一个项目
艾斯团队专注表观组学10年,提供专业有价值的DNA甲基化完整解决方案;
最早开发MeDIP-seq技术团队之一, 严格的内参质控;
已经完成人、小鼠、大鼠、猪等多个物种MeDIP-seq项目经验;
核心团队在Nature communications, Genome biology等杂志发表多篇SCI论文;
专业的生物信息分析团队, 提供更多个性化分析思路和方案。
科学方案设计
从项目方案、样本处理、建库测序,到数据分析;
每个项目需要专业、有价值的建议;及时高效的沟通,以保障高质量研究成果。
样本类型和要求
样本类型 |
样本要求 |
基因组DNA |
总量≥ 3ug; 浓度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量 |
细胞、全血、动植物组织等 |
按照送样要求准备 |
备注:用封口膜密封样品; 干冰运输 |
数据分析
MeDIP |
分析内容 |
备注 |
标准分析 |
1、测序数据质量评估 |
过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
2、与参考基因组比对 |
测序Reads 在基因组上的分布 |
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3、Peak峰Calling |
甲基化DNA富集区域鉴定 |
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4、Peak图谱分析 |
Peak在基因组,染色体,功能元件上的分布 |
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6、组间差异Peak分析 |
寻找DMR及注释 |
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7、差异Peak基因分析 |
相关基因GO,KEGG富集分析 |
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高级分析 |
8、多组学整合关联分析 |
例如与转录组关联分析 |
9、其它定制化分析 |
结合课题背景亮点挖掘 |

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