DNA 6mA免疫沉淀测序 (6mA-IP Seq)
DNA 6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)
N6-甲基脱氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修饰类型之一，
在细菌、藻类及植物基因组中广泛存在，在DNA错配修复、染色体分离和毒力调节中发挥作用。
6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)通过特异性抗体富集6mA甲基化的DNA片段，结合NGS测序技术在全基因组水平上分析6mA修饰信息。
用心服务每一个项目
专注表观组学10年，提供专业有价值的DNA甲基化完整解决方案；
国内较早开发6mA-seq技术团队之一, 严格的内参质控；
已经完成藻类及动植物及人等多个物种6mA-seq项目经验;
专业的生物信息分析团队, 提供更多个性化分析思路和方案。
科学方案设计
从项目方案、样本处理、建库测序，到数据分析；
每个项目需要专业、有价值的建议；及时高效的沟通，以保障高质量研究成果。
样本类型和要求
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样本类型 |
样本要求 |
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基因组DNA |
总量≥ 5ug; 浓度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量 |
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动植物、藻类、低等生物等 |
按照送样要求准备 |
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备注：用封口膜密封样品; 干冰运输 |
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数据分析
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6mA-IP Seq |
分析内容 |
备注 |
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标准分析 |
1、测序数据质量评估 |
过滤掉低质量数据，保证数据质量 |
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2、与参考基因组比对 |
测序Reads 在基因组上的分布 |
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3、6mAPeak峰Calling |
6mADNA富集区域鉴定 |
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4、6mAPeak图谱分析 |
6mAPeak在基因组，染色体，功能元件上的分布 |
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6、组间差异6mAPeak分析 |
寻找6mADMR及注释 |
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7、差异6mAPeak基因分析 |
相关基因GO，KEGG富集分析 |
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高级分析 |
8、多组学整合关联分析 |
例如与转录组关联分析 |
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9、其它定制化分析 |
结合课题背景亮点挖掘 |
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