Circulating free DNA羟甲基化解决方案

项目介绍

参数

常见问题

应用案例

提供cfDNA羟甲基化解决方案

cfDNA (circulating-free cell DNA), 又称循环 DNA 或无细胞DNA, 是指存在于血浆或血清的细胞外DNA；

ctDNA（circulating tumor DNA）携带了肿瘤基因组5hmC羟甲基化信息，

并且在最近几年5hmC已经作为一种重要癌症筛查标志物的研究，具有重要的临床价值。

完整解决方案，服务每一个项目

艾斯基因专注表观组学10年，提供专业的DNA羟甲基化整体解决方案；

已经完成1000+例样本cfDNA羟甲基化项目经验;

解决从血液采集保存、cfDNA分离提取(>90%得率)，

低至15ng输入量的微量羟甲基化捕获文库构建，

全方位助力cfDNA羟甲基化biomarker筛选及转化应用。

样本要求

cfDNA样本准备注意事项

在体内cfDNA在血浆里核酸酶的作用下，不断降解消失，

同时新的ctDNA和cfDNA进入血浆中，维持一定的动态和半衰期；

抽血离体之后ctDNA会继续降解、含量逐步减少，而来自白血细胞的cfDNA持续进去血浆，进而稀释ctDNA浓度，降低检测信号。

因此，在采血、血浆分离及保存运输都会影响数据的质量

抽血及暂存注意事项
EDTA抗凝管	在2-8度冰箱暂放；在8小时内低温离心分离血浆
Streck等采血管	在2-8度冰箱或者常温暂放；在48小时内离心分离血浆
注意：全血样本在分离出血浆之前，千万不要冷冻保存
血浆分离
采取两轮离心分离血浆，4℃条件下以 1600g 离心10min， 4℃条件下以 16000g 离心10min；要求EDTA抗凝管采血管需要低温条件离心； Streck等采血管建议低温离心，也可以常温离心，不受到影响
保存及运输
分离的血浆存放于-80℃冰箱保存(3年内都可以); 使用干冰运输。
cfDNA提取产量
cfDNA的含量存在较大的波动及异质性；一般正常人及肿瘤早期, 5-15ng/ml血浆；肿瘤晚期或者化疗等病人, cfDNA浓度显著提高